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Flora
Coralito (Eritrina sp.)
Torito (Stanhopea oculata)
Roble (Quercus segoviensis)
Se encuentran parches de bosques en buenas condiciones en las partes altas y partes hondas donde es difícil la ganadería y la agricultura. En las partes planas donde se realiza agricultura lo que hay son especies de crecimiento secundario como: Melastomatáceas, Croton sp. (Euphorbiaceae), Inga sp. (Mimosaceae). Las especies más abundantes son: Ocotea spp., Persea spp., Nectandra spp., (Lauraceae), Cupania sp. (Sapindaceae), Quercus spp. (Fagaceae), los de hojas finas lo llaman Sauce y los de hojas anchas robles de montaña, encinos, roble-encinos.
La masa boscosa más importante es El Tayacán, al oeste de Puertas Azules. Algunos de estos bosques se encuentran, como en Yarculí, frente a El Cebollal. Los árboles remanentes en el bosque pueden alcanzar hasta unos 30 m de altura, en la Laguna de Miraflor se encuentra un bosque en los alrededores de unos 30 m de altura, donde predominan Las Luaraceae, bejucos como Vitis tiliifolia (Vitaceae), en las epífitas abundan Orchidaceae, Bromeliaceae, alrededor del cuerpo de agua hay abundancia de Pontederiaceae, Cyperaceae de 3 m y pequeñas, entre otras.
Estas masas boscosas albergan especies comunes: Aguaslipe Areno (Ilex carpenterae), coralito (Eritrina sp.), Mora (Clorophora tinctoria), cedro real (Cedrela odorata) y varias especies de roble (Quercus segoviensis, Q. piruchana, Q. peduncularis, Q. sapotafolia). Los arbustos incluyen al Quesillo (Malvaviscus arboreus) y la Guayaba rayana (Eugenia sp) en algunas áreas pequeñas de bosques muy espaciados, intercaladas con extensas áreas de vegetación herbácea, malezas aisladas en unos casos y compactas en otros.
En el área se caracterizaron tres tipos de
bosque representativos:
1. Bosque de latifoliadas propios del trópico seco,
2. Bosque de roble asociado con coníferas
3. Bosque húmedo tropical de nebliselva.
En la formación pino - roble predominan Pinus oocarpa y varias especies de Quercus sp ubicados en áreas de pendientes moderadas a muy pronunciadas y terrenos pedregosos con poca vegetación en el sotobosque.
El Bosque nuboso esta representado por el sector de Los Volcancitos aunque también se puede encontrar algunos fragmentos en el área de la Laguna de Miraflor, El Cebollal, los Apantes, La Fortuna y Las Nubes. Estos sitios presentan árboles con alturas que pueden llegar a los 25 mts de altura y diámetros promedios entre 20 cm. y 80 cm., las especies características aquí son el Posan (Nectandra sp), canelo (Nectandra reticulada), con presencia de lianas y epífitas notorias, con barba de viejo (Tillandsia uncides) asociadas con el bosque de robles, las cuales son mas frecuentes en la zona de las Mesas de Moropotente.
El bosque seco se encuentra ubicado al Sureste y se encuentra muy alterado a causa de las extracciones madereras (leña para autoconsumo y construcción de infraestructura) y por los efectos de la ganadería extensiva. Las especies energéticas más comunes son el Quesillo (Malvabiscus arboreus), Quebracho (Lisiloma sp) Matapalo (Ficus sp) y Carbón (Acacia pennatula).
Los bosques están fragmentados pero por su composición florística son interesantes.
En el bosque de galería se encuentran el Carbón (Astronium graveolens), Níspero de montaña, Zapotillo (Quercus oleoides), Cedro real, Chapulin, madroño Chilamate, Guarumo, Ceiba-pochote, Jilinjoche, Guacimo de molenillo, aguacate de monte.
De acuerdo al estudio Caracterización del Área Demostrativa Miraflor-Moropotente realizado por la Universidad Politécnica, UPOLI, se definió la clasificación de la masa boscosa presente en las áreas protegidas Miraflor y Moropotente, identificando los siguientes: Bosque alto cerrado, Bosque bajo cerrado, Bosque alto abierto, Bosque bajo abierto, Bosque de pino, Bosque regeneración de pino, Regeneración natural.